第二三脚趾根部疼痛，要依据具体原因来处理。若是痛风引起需用抑制尿酸生成及促进尿酸排泄药物；若因骨折则要用外夹板固定或手术治疗；若为骨性关节炎所致需用非甾体类抗炎药、营养软骨药物。
一、痛风：当体内尿酸过高时易引发痛风，而脚趾关节常是发作部位，可出现痛风结节且疼痛明显。此时可口服抑制尿酸生成药物如别嘌醇片，其能减少尿酸生成；以及促进尿酸排泄药物如苯溴马隆胶囊、氨苄西林丙磺舒颗粒等，可促进尿酸排出体外，从而有助于改善痛风症状。
二、骨折：脚趾根部外伤可能导致骨折从而引起疼痛。要及时前往医院进行拍片检查，一旦发现有骨折，需立刻制动，并用外夹板固定，若骨折情况严重还需进行手术切开内固定治疗。
三、骨性关节炎：部分人出现这种情况是骨性关节炎导致的，除疼痛外还会伴有红肿、活动受限等表现。可使用非甾体类抗炎镇痛药如阿司匹林肠溶胶囊、吲哚美辛胶囊等，能缓解疼痛；同时使用营养软骨的药物如氨基葡萄糖胶囊等，可起到一定的养护作用。
总之，对于第二三脚趾根部疼痛，需明确原因后针对性采取治疗措施，以缓解疼痛等不适症状。