结肠炎的症状多样，常见的有腹泻，一般每天可能会排便3~5次甚至更多，大便多为黏液便、脓血便等。
肠道相关症状
腹痛表现： 不同类型的结肠炎腹痛特点有所不同。比如溃疡性结肠炎，多为左下腹或下腹隐痛，也可能涉及全腹，疼痛后常有便意，便后疼痛可缓解。而克罗恩病引起的腹痛常位于右下腹或脐周，呈间歇性发作，为痉挛性阵痛伴腹鸣。腹泻情况： 除了频率增加，腹泻的性状也有差异。有的结肠炎患者腹泻时大便呈糊状，有的则是水样便，还可能伴有黏液或脓血。像感染性结肠炎可能腹泻次数更多，且粪便中脓血相对明显。
全身症状
发热现象： 中重度结肠炎患者可能出现发热症状，体温一般在37.5℃~38.5℃左右，少数严重患者会出现高热，体温超过38.5℃。如果是由细菌感染引发的结肠炎，发热可能更明显且持续时间相对较长。营养不良表现： 长期患有结肠炎的患者，由于肠道吸收功能受到影响，可能会出现营养不良的情况，表现为体重下降、消瘦，还可能伴有贫血，出现面色苍白、乏力等症状。儿童患者如果患有结肠炎，还可能影响生长发育，导致身高、体重增长缓慢。
肠道外表现
关节症状： 部分结肠炎患者会出现关节疼痛、肿胀等症状，以大关节受累较为常见，如膝关节、踝关节等，可单侧或双侧发病，活动时疼痛可能加重。比如患有强直性脊柱炎相关的结肠炎患者，关节症状可能更为明显，且可能伴有关节僵硬，早晨起床时较为显著。皮肤表现： 有些结肠炎患者会出现皮肤病变，如结节性红斑，表现为下肢伸侧的红色结节，有压痛；还有的可能出现坏疽性脓皮病，皮肤出现溃疡、脓疱等改变。这些皮肤症状往往与结肠炎的病情活动相关，病情缓解时皮肤症状可能有所减轻。