阴茎上皮肤长硬痘痘可能由多种原因引起，比如皮脂腺囊肿，这是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿，一般可摸到皮下有圆形肿物，中等硬度，有弹性。
可能的原因一：毛囊炎
细菌感染引发： 多是金黄色葡萄球菌等细菌感染导致。皮肤卫生状况差时容易发生，比如长时间不清洗阴茎部位，细菌容易滋生感染毛囊，引发炎症，出现硬痘痘，可能还伴有红肿、疼痛等症状。真菌感染相关： 像念珠菌感染也可能引起阴茎皮肤毛囊炎样改变，出现硬痘痘，往往还会有局部瘙痒等表现。
可能的原因二：尖锐湿疣
人乳头瘤病毒感染： 由人乳头瘤病毒（HPV）中的低危型感染引起，通常通过性接触传播。一般在感染后1 - 8个月发病，阴茎部位会出现单个或多个淡红色小丘疹，逐渐增大增多，可呈菜花样、鸡冠样等外观的硬痘痘。
可能的原因三：珍珠状阴茎丘疹
病因不明但有特征表现： 其病因目前尚不明确，可能与局部刺激、生理发育变异等有关。多见于20 - 40岁左右的男性，表现为阴茎冠状沟处有珍珠状、半透明的丘疹，颜色多为白色、黄色或淡红色，质地较硬，一般无自觉症状。
可能的原因四：阴茎硬结症
纤维组织增生导致： 是阴茎海绵体白膜的纤维化病变，发病原因可能与创伤、遗传、自身免疫等因素有关。患者阴茎背侧可摸到单个或多个硬结，质地较硬，可伴有阴茎弯曲、疼痛等症状，尤其是在阴茎勃起时明显。