先天性扁桃体肥大主要有药物治疗和手术治疗两种方法，具体需根据扁桃体肥大程度及患者情况来决定。
一、如果是单纯性先天性扁桃体肥大，未出现明显临床症状，也不影响工作和学习，通常无需特殊处理。
1.这是因为此时扁桃体肥大可能只是一种生理状态，不一定会带来健康问题。
二、若先天性扁桃体肥大合并感染，出现扁桃体发炎，急性发作时可选用抗生素治疗，炎症消除后症状会改善。
1.抗生素能有效杀灭引起感染的病菌，减轻炎症反应。
2.及时治疗可以缓解患者的不适症状，如咽痛等。
三、有些先天性扁桃体肥大患者会影响发声，有咽喉部异物感等表现，因造成咽腔狭窄甚至影响睡眠和进食，则建议通过手术切除肥大的扁桃体。
1.手术切除可以直接解决扁桃体肥大带来的一系列问题。
2.避免对生活质量造成持续的不良影响。
当小儿出现先天性扁桃体肥大时，一定要在医生的指导下，选择合适的治疗方案及处理方式，以免造成严重后果。
总结：先天性扁桃体肥大的治疗需综合考虑多种因素，包括扁桃体肥大的具体情况和患者自身状况等，要根据不同情况选择合适的治疗方法，小儿患者尤其要谨慎处理，遵循医生指导。