卵巢囊肿的成因较为复杂，可能与多种因素相关。一般来说，卵巢囊肿形成的原因包括生理性因素、内分泌因素以及环境与生活方式因素等。比如，在生理性因素中，女性在月经周期中，卵泡发育到一定阶段未正常排出，就可能形成生理性的卵巢囊肿，这种情况在育龄女性中较为常见，部分会在月经结束后自行消失。
生理性因素：
排卵相关：女性每个月会有卵泡发育，正常情况下卵泡成熟后会排卵。但有时卵泡没有正常排出，持续增大就可能形成卵泡囊肿，这种情况比较常见，一般直径通常在5厘米以内，多数在月经来潮后会自行缩小或消失。黄体形成：排卵后形成黄体，正常黄体直径一般不超过3厘米。如果黄体持续存在且不断增大，就可能形成黄体囊肿。有的黄体囊肿可能会引起腹痛等症状，但也有不少会在一段时间后自行消退。
内分泌因素：
激素失衡：卵巢是产生女性激素的重要器官，当体内激素平衡被打破时，容易引发卵巢囊肿。比如雌激素水平过高，可能会刺激卵巢组织增生，增加囊肿形成的风险。像一些患有多囊卵巢综合征的女性，就常常伴有卵巢囊肿，这与她们体内内分泌紊乱，雄激素水平相对升高，影响了卵巢的正常排卵和组织代谢有关。
环境与生活方式因素：
饮食不规律：长期高热量、高脂肪饮食，会影响身体的代谢功能，可能间接对卵巢功能产生影响，增加卵巢囊肿的发生几率。例如，长期大量摄入油炸食品、甜食等，会使身体处于一种代谢紊乱的状态，可能干扰卵巢的正常生理过程。生活压力大：长期精神压力过大，会影响人体的内分泌调节系统，导致激素分泌失调，进而影响卵巢的正常功能，增加卵巢囊肿的发病可能性。现代社会中，很多女性面临工作、生活等多方面压力，长期处于紧张状态，这对卵巢健康有一定不良影响。环境污染：长期接触一些有害的化学物质，如某些塑料制品中的化学添加剂等，也可能对卵巢功能产生不良作用，增加卵巢囊肿形成的风险。虽然具体的作用机制还在研究中，但已有一些研究提示环境污染与卵巢囊肿的发生存在一定关联。