肾结石的形成是多种因素共同作用的结果。一般来说，尿液中某些物质浓度过高，超出了尿液的溶解能力，就容易析出结晶，逐渐形成肾结石。比如，尿液中钙、草酸、尿酸等成分异常增多时，就可能引发肾结石。
代谢异常导致
尿液成分改变： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质排出量增加时，就容易形成结石。例如，尿钙排泄增多，就会使尿液中钙的浓度升高，增加钙盐结石形成的风险。尿酸代谢异常： 体内尿酸生成过多或尿酸排泄减少，会导致尿酸水平升高，当尿酸浓度超过尿液的溶解度时，就会形成尿酸结石。
局部因素影响
尿路梗阻： 尿路梗阻会使尿液排出受阻，导致尿液在肾脏内潴留，尿液中的结晶物质更容易沉积下来，从而促进肾结石的形成。比如，输尿管狭窄、前列腺增生等都可能引起尿路梗阻。感染因素： 泌尿系统感染时，细菌、脓块等会作为核心，使尿液中的矿物质围绕其沉积，进而形成结石。而且，感染还会改变尿液的酸碱度，影响结石的形成。
饮食生活习惯相关
饮水不足： 如果每天饮水量少于1500毫升，尿液就会浓缩，导致尿液中矿物质浓度升高，增加肾结石的发生几率。一般建议每天饮水量应达到2000 - 3000毫升以上。饮食结构不合理： 长期摄入高草酸食物，如菠菜、苋菜、巧克力等，会使尿液中草酸含量增多，容易形成草酸钙结石。另外，高嘌呤饮食，像动物内脏、海鲜等，会使尿酸生成增加，也易引发尿酸结石。