肾结石的形成是多种因素共同作用的结果。一般来说，尿液中某些物质浓度过高，超出了尿液的溶解能力，就容易析出结晶，逐渐形成肾结石。比如，尿液中钙、草酸、尿酸等成分异常增多时，就增加了肾结石的发生风险。
代谢异常导致
尿液成分改变： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质含量过高时，就容易形成结晶。例如，尿钙排泄增加，使得尿液中钙的浓度升高，超过了尿液的溶解度，钙就会沉积下来形成结石核心。据统计，约有80%的肾结石患者存在尿液成分的异常。尿酸代谢紊乱： 尿酸是嘌呤代谢的产物，如果体内尿酸生成过多或者肾脏排泄尿酸减少，会导致尿酸在尿液中浓度升高，进而形成尿酸结石。一些患有痛风的患者，由于尿酸代谢异常，更容易并发尿酸结石。
尿路梗阻相关
尿道狭窄等情况： 如果存在尿道狭窄、前列腺增生等问题，会导致尿液排出不畅。尿液在尿路中滞留时间过长，其中的晶体物质就容易沉淀下来，逐渐形成结石。比如，前列腺增生的患者，随着病情进展，尿液排出受阻，增加了肾结石形成的可能性。泌尿系统畸形： 像肾盂输尿管连接处狭窄、多囊肾等泌尿系统畸形，会影响尿液的正常流动，使尿液在局部积聚，为结石的形成创造条件。例如，肾盂输尿管连接处狭窄的患者，尿液排出不畅，容易引发肾结石。
饮食与生活习惯因素
饮水不足： 每天饮水量少于1500毫升时，尿液会浓缩，导致尿液中各种晶体物质的浓度升高，容易形成结石。研究发现，每天饮水少于1000毫升的人群，肾结石的发生率明显高于每天饮水2000毫升以上的人群。高草酸食物摄入过多： 菠菜、甜菜、巧克力、坚果等食物中草酸含量较高，如果长期大量食用，会使尿液中草酸浓度升高，增加草酸钙结石的形成风险。比如，长期过量食用菠菜的人，患草酸钙结石的几率会比一般人高。高嘌呤食物摄入过多： 动物内脏、海鲜、肉类等食物嘌呤含量较高，过多食用会使尿酸生成增加，进而容易形成尿酸结石。有调查显示，经常大量摄入高嘌呤食物的人群，尿酸结石的发病率比普通人群高出数倍。