脐疝主要是由于肚脐部位的组织发育不完善或存在薄弱环节导致的。婴儿时期，约有20%的早产儿和50%的低体重儿会出现脐疝，这主要是因为他们的脐环在出生后尚未完全闭合，腹腔内的脏器就容易从这个薄弱处突出形成脐疝。
先天发育因素：
脐环未闭： 胎儿在发育过程中，肚脐部位的脐环是最后闭合的结构之一。正常情况下，婴儿出生后1-2岁时脐环会逐渐闭合。但如果脐环本身发育异常，没有按时闭合，就为脐疝的形成埋下了隐患。比如一些胎儿在母体中脐环发育就比正常情况小，出生后就更容易出现脐疝。腹壁肌肉薄弱： 婴儿的腹壁肌肉相对薄弱，尤其是新生儿，腹壁肌肉的力量不足以完全维持腹腔内器官的位置稳定。当腹腔内压力升高时，比如婴儿哭闹、咳嗽、便秘等情况，腹腔内压力增加，就容易将腹腔内的肠管等组织挤压到脐部，从而形成脐疝。
后天因素影响：
腹腔内压力增高： 长期的腹腔内压力增高是引发脐疝的重要后天因素。例如，患有慢性咳嗽的人，由于频繁咳嗽，会使腹腔内压力持续升高。婴儿如果经常哭闹，也会导致腹腔内压力反复增加，进而促使脐疝的发生。还有一些患有便秘的婴儿，排便时需要用力，这也会使腹腔内压力升高，增加脐疝出现的几率。肥胖因素： 对于成年人来说，肥胖也是导致脐疝的一个因素。过多的脂肪堆积会使腹部压力增加，同时，肥胖者的腹壁组织相对薄弱，腹腔内的脏器容易通过薄弱部位突出形成脐疝。据统计，肥胖人群中脐疝的发生率比正常体重人群要高不少。