早上醒来嘴巴发苦的原因包括生理因素、睡眠因素、缺乏微量元素等。
一、生理因素：主要是因为在夜间长时间休息时，口腔未得到有效清洁，从而导致细菌滋生，所以早上醒来会有嘴巴发苦的感觉，这属于正常情况。对此，可以通过适当饮水或刷牙等方式，通常能使嘴巴发苦的症状得到明显改善。
二、睡眠因素：
1.有些人在夜间睡觉时习惯张口呼吸，或者是患有睡眠呼吸暂停综合征的人，其晚上睡眠质量往往相对较差，张口呼吸时空气未经过鼻腔的湿润，这样就容易使得早上睡醒后出现嘴苦现象。
三、缺乏微量元素：当身体缺乏维生素B12、锌元素等微量元素时，也会引发嘴苦。此时患者除了嘴苦症状外，还可能伴有食欲不振、恶心、贫血等表现。
如果出现早上醒来嘴巴发苦的情况，应及时就医检查，明确具体病因，并在医生的指导下进行相应的治疗。
总之，早上醒来嘴巴发苦可能由多种原因引起，需要根据具体情况进行分析和处理。