月经干净3天后同房是否会怀孕，需要根据具体情况进行分析，不能一概而论。以下是一些可能的情况：
1.怀孕的可能性较小：一般来说，女性的排卵期是在下次月经来潮前的14天左右，而月经干净3天通常还处于安全期，此时卵巢尚未排卵，同房怀孕的几率较低。但需要注意的是，女性的排卵时间可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而提前或推迟，因此安全期并不是绝对的安全。
2.月经失调：如果女性的月经周期不规律，或者存在其他妇科疾病，如多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症等，那么月经干净3天后同房也可能会怀孕。此外，同房时如果没有采取有效的避孕措施，也可能导致意外怀孕。
3.其他因素：除了怀孕和月经失调外，还有一些其他因素可能会影响女性的月经周期和生育能力。例如，情绪紧张、压力过大、过度运动、饮食不规律等都可能导致月经失调。此外，某些药物（如避孕药、抗生素等）也可能对月经周期产生影响。
需要注意的是，每个人的身体状况和生理反应都不同，因此对于月经干净3天后同房是否会怀孕的问题，最好咨询医生或妇科专家的意见。此外，如果没有生育计划，建议在同房时采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等，以避免意外怀孕。同时，也要注意保持良好的生活习惯和饮食习惯，有助于维持月经周期的正常和生育能力的健康。