扁桃体炎的症状主要有局部症状和全身症状等。一般来说，急性扁桃体炎常见咽痛，初起多为一侧疼痛，继而可发展至双侧，吞咽时疼痛加剧，严重者可影响吞咽功能。儿童急性扁桃体炎可能会出现高热，体温可达39℃~40℃，甚至可能引发惊厥。
局部症状表现
咽痛： 这是扁桃体炎最常见的局部症状之一，尤其是急性扁桃体炎患者，咽痛较为明显，开始可能是一侧咽痛，随后可发展为双侧咽痛，在吞咽时疼痛会加重，有的患者会感觉咽痛剧烈，甚至影响进食和说话。吞咽困难： 由于咽部疼痛，尤其是扁桃体肿大明显时，会导致吞咽困难，儿童可能表现为流口水，大一点的孩子会说吞咽时不舒服。扁桃体红肿： 检查时可见扁桃体充血、肿胀，表面可能有白色或黄色的渗出物，这在急性化脓性扁桃体炎中比较典型。
全身症状表现
发热： 急性扁桃体炎患者常常会出现发热症状，体温可高可低，儿童相对更容易出现高热，有的体温能达到39℃以上，而且发热持续时间不一，有的患者发热1~2天，有的可能持续3~5天。全身不适： 患者可能会感到全身乏力、肌肉酸痛、头痛等，精神状态也会受到影响，显得比较萎靡。比如儿童可能会不愿意玩耍，喜欢安静地躺着。食欲减退： 因为咽部疼痛和发热等原因，患者的食欲会明显下降，不想吃东西。
不同类型扁桃体炎的特殊症状
急性滤泡性扁桃体炎： 除了上述一般症状外，扁桃体实质内会出现散在的黄白色滤泡。急性隐窝性扁桃体炎： 扁桃体隐窝口有渗出物，呈点状或片状，像黄白色的伪膜，但伪膜容易剥离，不与组织紧密粘连。慢性扁桃体炎： 全身症状相对较轻，可能会有低热，还会反复出现咽部不适、异物感、刺激性咳嗽等症状，有的患者会感觉喉咙有堵塞感，早上起床后可能会有口臭，这是因为扁桃体隐窝内有干酪样腐败物。