腰椎间盘突出微创手术后可能出现一些后遗症，比如神经损伤相关后遗症，大约有5% - 10%的患者可能出现轻微的神经感觉异常，像皮肤麻木等情况。
感染相关后遗症
切口感染：微创手术切口较小，但仍有感染风险，一般发生率在1%左右。如果发生切口感染，会出现切口红肿、疼痛、有分泌物等症状。椎管内感染：相对少见，发生率约为0.5%以下，但一旦发生后果较严重，可能会出现发热、腰痛加重、下肢无力等表现。
脑脊液漏相关后遗症
短期症状：术后可能出现头痛，尤其是坐起或站立时头痛明显，发生率大概在2% - 5%。这是因为脑脊液漏导致颅内压降低引起的。长期影响：少数患者可能会有低颅压性头痛持续较长时间，影响康复进程，不过这种情况比较罕见。
复发相关后遗症
复发情况：虽然微创手术复发率相对传统开放手术低，但仍有部分患者会复发，一般1年内复发率约为2% - 4%。复发后可能又出现腰痛、下肢放射痛等原来的症状，需要再次治疗。
腰部肌肉力量减退后遗症
早期表现：术后由于手术对腰部肌肉等组织的影响，部分患者在术后1 - 3个月内可能会感觉腰部力量有所下降，比如提重物等活动会比较吃力。恢复情况：经过康复锻炼大部分可以改善，但有少数患者可能恢复不完全，影响日常腰部活动功能，不过通过规范康复训练大多能得到不同程度改善。