儿童软疣可以通过局部治疗等方式来处理，比如常用的有刮除术等方法。
局部治疗方法
刮除术： 这是比较常用的方法，由医生用特制的刮匙将软疣小体完全刮除，然后涂以2%碘酊，压迫止血即可。一般操作比较简单，对于单个或少数的软疣可以采用这种方式。冷冻治疗： 利用低温液氮的低温作用，使软疣组织坏死脱落。冷冻治疗可能需要多次进行，治疗后局部可能会出现水疱等情况，但一般能逐渐恢复。治疗时要注意保护周围正常皮肤。
药物辅助治疗
抗病毒药物： 对于一些复发性或者泛发性的软疣，可能会辅助使用抗病毒药物。比如可以外用维A酸软膏等，维A酸软膏可以调节上皮细胞的生长和分化，对软疣有一定的治疗作用，但使用时要注意按照医生的指导，避免接触到正常皮肤。不过对于儿童使用药物要谨慎，需在医生评估后使用。
日常护理要点
保持皮肤清洁： 要让儿童保持皮肤的清洁卫生，勤给儿童洗澡，洗澡时避免过度搓擦皮肤，防止皮肤破损而导致软疣扩散。避免搔抓： 要告诫儿童不要搔抓软疣部位，因为搔抓可能会导致自身接种，使软疣扩散到身体其他部位，引起更多的软疣生长。注意个人物品卫生： 儿童使用的毛巾、衣物等要单独清洗，并且可以进行暴晒等消毒处理，防止交叉感染。同时，要避免儿童与他人共用毛巾、衣物等物品。