新生儿指甲根部发黑可能由生理性因素如遗传、末梢循环较差等导致，也可能因病理性因素如先天性心脏病、肺炎等引起，必要时需请医生明确诊断以避免休克等不良情况发生。具体如下：
一、生理性因素：
1.遗传：可能因局部色素细胞过多，导致新生儿指甲根部发黑。
2.末梢循环较差：这通常是由于新生儿体温调节系统功能发育不完善，当外界温度过低或衣服穿着过紧时，就可能出现指甲根部发黑情况。此时家长需及时调整室内温度、适当增加衣物或给新生儿更换宽松衣物，可使该情况得到缓解。
二、病理性因素：
1.先天性心脏病：
(1)患病新生儿可能出现组织器官供血障碍，引起组织缺氧，从而存在指甲根部发黑现象。对于临床症状不明显且不影响生长发育的疾病如房间隔缺损，可使用辅酶Q10治疗，生活中要避免剧烈活动，作息规律。存在动脉导管未闭的新生儿则建议尽早手术治疗。
2.肺炎：
(1)吸入性肺炎：当新生儿吸入异物导致肺部出现炎症反应或感染，表现为气道阻塞、呼吸困难，因缺氧可出现指甲根部发黑，还可能有皮肤发绀等症状。建议先进行吸氧治疗改善通气，然后可进行X线检查，必要时使用广谱抗生素如红霉素治疗。
(2)感染性肺炎：可能因各种因素如羊水、致病微生物等导致，表现为低体温、抽搐甚至呼吸、循环衰竭等，此时也会有指甲根部发黑现象。可进行雾化吸入，定期给新生儿拍背并及时清理口鼻内的分泌物。对呼吸困难的新生儿进行吸氧支持治疗，同时控制感染，如用第三代头孢菌素、氨苄青霉素、红霉素等进行对应治疗。如果出现其他并发症，还需针对并发症积极处理。
3.其他因素：如休克，因全身循环障碍也可能导致指甲根部发黑。建议及时到医院治疗，及时补充体液并明确休克原因。若是大出血导致需及时输液治疗，若因过敏引起需及时使用抗过敏药物如氯雷他定、西替利嗪等进行抗过敏治疗。
总之，当新生儿出现指甲根部发黑情况且家长无法有效判断时，应及时到医院咨询医生，若为疾病引起需在医生指导下治疗，以免延误病情导致严重后果。