三叉神经痛若药物治疗效果不佳，便会进入有创治疗阶段。当前国内外有创治疗三叉神经痛常见手段包括：一、显微血管减压手术，这是首先推荐的手术方案，有效率高、并发症少、复发率低且无后遗症，但因是开颅手术有风险，且80岁以上病人总体不建议做；二、射频热凝手术；三、经皮三叉神经节球囊压迫手术；四、甘油注射三叉神经节手术；五、伽玛刀手术等。
一、显微血管减压手术：是目前治疗三叉神经痛的首要手术选择，其优势明显，有效率高、并发症少、复发率低，还没有后遗症。不过因为属于开颅手术，所以存在一定治疗风险。同时，三叉神经痛显微血管减压手术要求病人能耐受全麻，80岁以上病人通常不适合。
二、其他手术方案：如射频、伽马刀、球囊压迫和甘油注射等，它们的原理均为对三叉神经节进行毁损。这些方案相对创伤较小，手术效果也较好，但存在较大缺点，即会有并发症，往往导致半侧脸麻木、无感觉，甚至可能出现角膜溃疡等。而且最重要的是，绝大多数病人会复发，不过复发后可重复手术。
所以对于三叉神经痛的有创治疗，首选是显微血管减压手术，其次才是其他如射频、伽马刀等手术方案。