孕妇甲减对胎儿发育有较大影响，研究表明，孕妇若未控制好甲减，约30%的胎儿智力发育可能受到影响。
对胎儿神经系统发育的影响
智力发育方面： 甲状腺激素对胎儿神经系统的正常发育至关重要。孕妇甲减时，体内甲状腺激素水平偏低，会影响胎儿大脑的正常分化和发育。胎儿在妊娠早期（尤其是妊娠前12周），自身还不能合成甲状腺激素，完全依赖从母体获取。如果孕妇甲减，就无法为胎儿提供充足的甲状腺激素，可能导致胎儿脑发育迟缓，出生后智力水平低于正常婴儿。神经细胞发育： 甲状腺激素参与神经细胞的增殖、迁移和分化等过程。孕妇甲减会干扰这些过程，使得胎儿神经细胞的发育出现异常，影响胎儿未来的认知能力、注意力等。
对胎儿生长发育的影响
身高体重增长： 甲状腺激素能促进胎儿的生长发育，包括骨骼的生长和体重的增加。孕妇甲减时，胎儿得不到足够的甲状腺激素刺激，骨骼发育会受到阻碍，可能导致胎儿出生时身高、体重低于正常标准。有研究发现，孕妇甲减未控制的情况下，胎儿出生体重平均比正常孕妇所生胎儿低约200 - 300克。器官发育： 除了骨骼和体重，甲状腺激素对胎儿其他器官的发育也有影响。比如心脏等重要器官的发育可能会因为甲状腺激素不足而出现异常，影响胎儿出生后的整体健康状况。
增加胎儿流产、早产风险
流产风险： 孕妇甲减会使体内激素平衡失调，影响子宫内环境的稳定。研究显示，孕妇甲减未治疗时，流产发生率比正常孕妇高出约10% - 15%。因为甲状腺激素不足会干扰胚胎的着床和发育过程，增加胚胎停育和流产的可能性。早产风险： 甲减还可能影响胎盘的功能，导致胎盘供血、供氧不足等情况，进而增加胎儿早产的风险。有数据表明，孕妇甲减未控制时，早产发生率较正常孕妇升高约8% - 12%。