怀孕时腋窝疼可能由毛囊炎、淋巴结炎、副乳等导致，可到医院检查后针对病因进行相应治疗，具体如下：
一、毛囊炎：这是发生于毛囊及其周围的化脓性皮肤病，头面部、颈部、大腿、臀部、腋窝等都是好发部位，主要表现为毛囊周围红色丘疹，有时会有化脓、瘙痒、疼痛等症状。所以怀孕时腋窝疼可能是毛囊炎引起。患者可遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏、复方多粘菌素B软膏等药物进行治疗。
1.莫匹罗星软膏：可用于治疗多种细菌感染引起的皮肤病。
2.夫西地酸乳膏：对一些革兰氏阳性球菌有较好的抗菌作用。
3.复方多粘菌素B软膏：具有抗菌、止痛等作用。
二、淋巴结炎：是由致病菌感染引发的淋巴结炎症，颈部、腋窝、腹股沟等常见，主要临床表现为淋巴结肿大、疼痛，很可能造成怀孕时腋窝疼。患者可遵医嘱使用头孢氨苄片、罗红霉素片、阿莫西林胶囊等药物治疗。
1.头孢氨苄片：是一种头孢菌素类抗生素。
2.罗红霉素片：属于大环内酯类抗生素。
3.阿莫西林胶囊：为青霉素类抗生素。
三、副乳：怀孕时体内激素旺盛，可能致使乳腺管扩张进而引起副乳，这可能引发腋窝疼。副乳一般不影响健康，建议患者饮食清淡、注意休息、避免过度劳累，保证充足睡眠。
总之，怀孕时腋窝疼可能有多种原因，要明确具体病因并采取相应的治疗措施。同时，患者在治疗期间要遵医嘱用药，注意生活方式的调整。