小肠肠壁增厚可能由多种原因引起。其中炎症性因素较为常见，比如克罗恩病，这是一种慢性炎性肉芽肿性疾病，可累及胃肠道各部位，导致小肠肠壁增厚，患者可能伴有腹痛、腹泻、体重下降等症状；还有感染性肠炎，如细菌、病毒感染肠道后，引发炎症反应，也可能使小肠肠壁增厚，一般感染后可能在数天到数周内出现相关症状。
一、肿瘤性因素
原发性小肠肿瘤： 像小肠腺癌、平滑肌瘤等原发性肿瘤，会导致小肠肠壁异常增厚。小肠腺癌患者可能有腹痛、肠梗阻、消化道出血等表现；平滑肌瘤患者症状相对不特异，可能有腹部隐痛等情况。转移性肿瘤： 其他部位的恶性肿瘤转移到小肠，也会引起肠壁增厚，比如结直肠癌转移至小肠，这种情况往往是肿瘤晚期的表现，患者除了小肠肠壁增厚外，还可能有原发肿瘤相关的一些症状，如结直肠癌患者可能有便血、排便习惯改变等。
二、缺血性因素
肠系膜血管病变： 当肠系膜动脉发生粥样硬化、栓塞等情况时，会导致小肠供血不足，长期缺血可引起肠壁增厚。例如肠系膜动脉栓塞多在数小时内发病，患者会出现剧烈腹痛、呕吐等症状；肠系膜动脉粥样硬化一般病程较长，可能逐渐出现肠道功能紊乱等表现。低灌注状态： 严重的创伤、休克等导致全身血液循环灌注不足时，小肠也可能因缺血出现肠壁增厚，患者在有创伤、休克等基础病因的情况下，可能伴有血压降低、心率加快等全身表现。
三、寄生虫感染因素
肠绦虫感染： 当人体感染肠绦虫后，绦虫在小肠内寄生，可引起肠壁的免疫反应，导致肠壁增厚。患者可能有腹部不适、消化不良等症状，部分人能在粪便中发现绦虫节片。其他寄生虫： 比如贾第虫等寄生虫感染小肠，也可能造成肠壁增厚，一般会有腹泻、腹痛等消化道症状，腹泻可能呈稀水样便等。