卵巢囊肿的治疗时间取决于其性质与大小，常见的卵巢囊肿包括卵巢巧克力囊肿、功能性卵巢囊肿以及赘生性卵巢囊肿。
一、卵巢巧克力囊肿：这主要是由于子宫内膜在卵巢部位生长而引发的。其治疗应从发现时就开始重视。对于较小的卵巢巧克力囊肿患者，可以通过服用孕激素、短效避孕药等药物来进行治疗；一般来说，直径达到4至5厘米及以上的巧克力囊肿，就需要通过手术将囊肿剥除或者切除。
二、功能性卵巢囊肿：大多属于生理性的卵巢囊肿，常见的类型有黄体囊肿、滤泡囊肿等。因为多数功能性卵巢囊肿通常会自行消退，所以很多情况下并不需要进行特殊治疗，只需密切进行观察即可。
三、赘生性卵巢囊肿：常见的类型包含卵巢囊腺瘤、卵巢畸胎瘤、卵巢恶性肿瘤等。由于这是病理性的卵巢肿瘤，不管是良性还是恶性，一旦被发现，就应该立刻进行手术。
总之，对于卵巢囊肿的治疗，需要根据具体类型来确定合适的时机和方法，及时诊断和恰当处理对于患者的健康非常重要。