腔隙性脑梗塞常用的药物有抗血小板聚集药物、他汀类药物等。一般来说，抗血小板聚集药物中常用的有阿司匹林等，他汀类药物常用的有阿托伐他汀等。
抗血小板聚集药物
阿司匹林： 通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板聚集。一般建议有适应证的患者长期服用，但要注意部分人可能出现胃肠道不适等不良反应。氯吡格雷： 也是一种抗血小板聚集药物，对于不能耐受阿司匹林的患者可以考虑使用，它通过特异性地抑制ADP介导的血小板活化。
他汀类药物
阿托伐他汀： 可以降低血脂，尤其是低密度脂蛋白胆固醇，还能稳定动脉粥样硬化斑块，减少斑块破裂的风险，对腔隙性脑梗塞的二级预防有重要作用。不过，使用过程中需要定期监测肝功能等指标。瑞舒伐他汀： 同样属于他汀类药物，也具有降低血脂、稳定斑块的作用，其降血脂的作用可能相对较强一些，在使用时也需要关注肝功能等情况。
改善脑循环药物
丁苯酞： 可以改善脑缺血区的微循环和血流量，促进脑梗死区域的侧支循环建立，从而改善患者的神经功能缺损症状。一般需要在发病早期合理使用。长春西汀： 能抑制磷酸二酯酶活性，增加血管平滑肌松弛的信使c-GMP的作用，扩张脑血管，改善脑血液循环和脑代谢。
控制基础疾病药物
降压药： 如果患者有高血压，需要根据情况选用合适的降压药物，将血压控制在合适范围，比如常用的有硝苯地平、依那普利等。要注意平稳降压，避免血压波动过大。降糖药： 对于合并糖尿病的患者，需要使用降糖药物控制血糖，如二甲双胍等，要使血糖控制在合理水平，以减少对血管等的损害，降低腔隙性脑梗塞复发的风险。