新生儿先天性心脏病的症状表现多样。一般来说，部分患儿可能会出现呼吸急促的情况，尤其是在活动或吃奶时，呼吸频率可能会明显增快，有的新生儿呼吸频率能达到60次/分钟以上。
皮肤颜色方面的症状
口唇发紫： 这是比较常见的症状之一。当新生儿存在先天性心脏病时，由于心脏供血供氧不足，可能会导致口唇呈现青紫颜色，特别是在哭闹、吃奶等情况时，发紫现象可能会更明显。甲床发紫： 除了口唇，新生儿的甲床也可能出现发紫的情况，通过观察手指或脚趾的甲床颜色可以发现异常。
喂养方面的症状
吃奶困难： 患有先天性心脏病的新生儿往往吃奶比较费力，可能会出现吸吮无力的情况，而且吃奶时间较长，吃一会儿就需要休息，因为心脏供血问题导致身体能量供应不足，从而影响吃奶的状态。体重增长缓慢： 由于吃奶困难，摄入的营养不足，新生儿体重增长会比正常新生儿缓慢，可能在相同时间内体重增加不明显甚至下降。
呼吸相关的其他症状
反复肺炎： 因为心脏结构异常导致肺部血液回流受阻，肺部容易淤血，这样就容易引发反复的肺部感染，出现肺炎的情况，表现为咳嗽、发热、呼吸增快等症状，而且这种肺炎可能比较难以治愈，容易反复发作。喘息： 部分新生儿在安静状态下也可能出现喘息的情况，呼吸时感觉比较费力，胸部起伏较大。