新生儿先天性心脏病的症状表现多样，部分新生儿可能在出生后不久就出现一些异常情况。比如，约有1/3的重症先天性心脏病患儿在出生后1-2天内就会出现呼吸急促的症状，每分钟呼吸次数可能超过60次。
呼吸方面的症状
呼吸急促： 新生儿先天性心脏病时，心脏功能受到影响，可能导致肺部淤血，进而引起呼吸急促。除了频率加快外，还可能伴有呼吸费力，比如鼻翼扇动、胸骨上窝和肋间凹陷等表现。反复肺炎： 由于心脏结构异常，肺部血液循环不畅，容易导致肺部充血，使新生儿容易反复发生肺部感染，出现咳嗽、发热等肺炎相关症状。
生长发育方面的症状
生长迟缓： 患有先天性心脏病的新生儿，因为心脏供血不足，身体各器官得不到充足的营养供应，可能会出现生长发育落后于同龄新生儿的情况，体重增长缓慢，身高也可能低于正常水平。体重不增： 心脏功能异常影响了营养物质的正常输送，导致新生儿摄入的营养不能很好地被利用来维持体重增长，表现为体重持续不增加甚至下降。
皮肤颜色方面的症状
口唇发紫： 当先天性心脏病导致血液中氧含量降低时，新生儿的口唇、指甲等部位可能会出现青紫现象，尤其是在哭闹、吃奶等用力的情况下，发紫情况可能会加重。比如在新生儿哭闹后，仔细观察会发现口唇明显发暗发紫。面色苍白： 部分先天性心脏病患儿可能会出现面色苍白的情况，这是因为心脏供血不足，全身血液循环不佳，导致面色失去正常的红润色泽，显得较为苍白。
其他方面的症状
喂养困难： 新生儿吃奶时可能会出现吸吮无力，吃奶时间比正常新生儿长，而且容易疲劳，吃几口就停下来喘气，导致喂养困难，摄入的奶量不足，进一步影响生长发育。心跳异常： 家长可能会发现新生儿的心跳过快或不规则，用听诊器检查时能发现心率明显异于正常范围，正常新生儿心率一般在120-140次/分钟左右，而先天性心脏病患儿可能心率更快或出现节律不齐。