肾结石的形成与多种因素相关。一般来说，尿液中某些物质浓度过高，超过了尿液的溶解限度，就容易析出结晶，逐渐形成肾结石。例如，当尿液中钙、草酸、尿酸等物质含量异常时，就可能引发肾结石。
代谢异常导致
尿液中成分异常： 人体新陈代谢过程中，如果尿液里钙、草酸、尿酸等物质排出量增多，就容易形成结石。比如，尿液中钙浓度过高时，钙就可能与草酸结合形成草酸钙结晶，长期积累可能发展成肾结石。还有尿酸代谢异常，尿酸排出过多，尿液中尿酸浓度升高，也易形成尿酸结石。尿量过少： 当人体喝水过少时，尿量会减少，尿液中各种形成结石的物质浓度就会升高，更容易析出结晶形成结石。一般建议肾结石患者每天饮水量应达到2000 - 3000毫升以上，保证足够的尿量来稀释尿液中的成石物质。
局部因素影响
尿路梗阻： 如果泌尿系统存在狭窄、畸形等情况，会导致尿液排出不畅。尿液在局部潴留，使得尿液中的结晶更容易沉积下来，从而增加肾结石形成的风险。比如肾盂输尿管连接部狭窄，就可能引发肾结石。感染因素： 泌尿系统感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使结石形成。而且感染还会改变尿液的酸碱度，影响一些物质的溶解度，进一步促进结石形成。例如，尿路感染时，细菌分解尿素产生氨，使尿液碱化，容易形成磷酸镁铵结石。
饮食生活习惯所致
高草酸食物摄入过多： 像菠菜、苋菜、巧克力、坚果等食物中草酸含量较高，如果长期大量食用，会使尿液中草酸浓度升高，增加草酸钙结石形成的几率。比如经常吃大量菠菜的人，相对更容易长肾结石。高嘌呤食物摄入过量： 动物内脏、海鲜、红肉等嘌呤含量较高，嘌呤代谢后会产生尿酸，长期大量摄入高嘌呤食物会使尿酸生成增多，容易形成尿酸结石。例如长期大量吃动物内脏的人，患尿酸结石的风险会增加。