包皮炎的治疗药物需根据病因选择，一般细菌感染引起的包皮炎，可外用莫匹罗星软膏等，通常用药后数天能有改善。
细菌感染性包皮炎用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥杀菌作用，可用于革兰阳性球菌引起的包皮感染，一般涂抹后局部炎症能逐渐消退。夫西地酸乳膏： 对引起包皮炎的常见细菌有良好的抗菌活性，通过抑制细菌的蛋白质合成来发挥抗菌功效，涂抹后能帮助减轻包皮的红肿、疼痛等症状。
真菌感染性包皮炎用药
克霉唑乳膏： 是抗真菌药物，作用机制是抑制真菌细胞膜的合成，影响其代谢过程，适用于念珠菌等真菌感染引起的包皮炎，使用后能抑制真菌生长，缓解瘙痒、红斑等症状。酮康唑乳膏： 同样为抗真菌药，可抑制真菌麦角固醇的生物合成，进而影响真菌细胞膜的完整性和功能，对真菌性包皮炎有较好的治疗作用。
非感染性包皮炎用药
糖皮质激素类药膏（短期使用）： 像氢化可的松乳膏，对于因过敏等非感染因素导致的包皮炎有一定抗炎、抗过敏作用，但要注意短期使用，避免长期应用引起不良反应，如皮肤萎缩等情况。不过这类药物需在医生指导下谨慎使用，因为使用不当可能会加重病情或带来其他问题。保湿修复类制剂： 当包皮炎是由于局部皮肤干燥等非感染非过敏因素引起时，可使用含有尿素、凡士林等成分的保湿修复制剂，帮助保持包皮局部皮肤的湿润，促进皮肤修复，辅助改善包皮炎状况。