骨髓炎主要是由细菌感染引起的，其中金黄色葡萄球菌是较为常见的致病菌。一般来说，当身体某个部位受到外伤，皮肤破损，细菌就有可能侵入骨骼引发骨髓炎，约有1/3的骨髓炎是由外伤伤口感染导致的。
创伤相关感染导致
开放性骨折引发： 当发生开放性骨折时，骨折断端与外界相通，外界的细菌很容易直接污染骨折部位的骨骼。比如，车祸导致的开放性胫骨骨折，伤口处的细菌就可能顺着骨折处侵入骨骼，引发骨髓炎。一般开放性骨折后24 - 48小时内，如果处理不及时，感染风险会明显增加。术后感染导致： 像骨科手术后，比如人工关节置换术等，如果手术部位消毒不彻底，或者患者术后抵抗力下降，就容易发生术后感染进而引发骨髓炎。有数据显示，骨科手术后发生骨髓炎的概率约为1% - 3%。
血源性感染引发
儿童常见血源性骨髓炎： 在儿童时期，由于儿童的骨骺板附近的微小终末动脉与毛细血管往往更为弯曲，容易形成血管襻，血液中的细菌容易在此处停滞。例如，金黄色葡萄球菌从身体其他部位的感染灶，通过血液循环到达儿童的长骨骨骺端，就可能引发骨髓炎，这种情况在5 - 15岁的儿童中相对多见。免疫力低下人群： 一些免疫力低下的人群，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病的人，身体抵抗细菌的能力较弱，血源性感染引发骨髓炎的风险更高。糖尿病患者因为血糖控制不佳，身体的抗感染能力下降，细菌更容易在血液中传播并定植在骨骼引发感染。
临近感染蔓延所致
软组织感染蔓延： 当身体某个部位的软组织发生严重感染时，感染可能会向周围的骨骼蔓延。比如足部的严重甲沟炎，如果没有及时控制感染，感染可能会蔓延到附近的趾骨，引发骨髓炎。甲沟炎如果是金黄色葡萄球菌感染，就有可能通过组织间隙向周围的骨质侵袭。牙周炎累及： 口腔内的牙周炎如果没有得到有效控制，炎症也可能向周围的颌骨蔓延。牙周炎中的细菌可以通过牙周袋周围的组织间隙侵入颌骨，引发颌骨的骨髓炎，尤其是一些长期患有重度牙周炎的患者，发生颌骨骨髓炎的风险相对较高。