关键点：三个月纯母乳宝宝腹泻的原因可能有生理因素、胃肠功能紊乱、急性肠炎等，可分别通过一般治疗、药物治疗来应对。
一、生理因素
纯母乳的三个月宝宝若喂养不当，可能出现偶尔的腹泻，且宝宝通常不会有明显哭闹。这种情况一般无需特殊治疗，关键在于要注意正确喂养，避免一次喂养过多。
二、胃肠功能紊乱
宝宝年龄小，胃肠功能较为娇弱，容易发生胃肠功能紊乱，可出现腹痛、腹胀、腹泻等表现。可在医生指导下使用双歧杆菌活菌散、盐酸美贝维林片等药物进行治疗。双歧杆菌活菌散能调节肠道菌群，盐酸美贝维林片可缓解腹痛等不适。
三、急性肠炎
多由病毒或细菌感染引起，会有腹痛、腹泻、呕吐等症状。可在医生指导下应用乳酸菌素片、双歧杆菌三联活菌散等药物。乳酸菌素片有助于调节肠道功能，双歧杆菌三联活菌散能改善肠道微生态。
总结概况提示：三个月纯母乳宝宝腹泻可能由多种原因引起，应根据具体情况选择合适的治疗方法，包括一般治疗和药物治疗等。同时要密切观察宝宝的症状变化，如有异常应及时就医。