三个月大的婴儿拉肚子，可能是正常的生理现象，也可能是由疾病引起的。如果拉肚子的同时，还伴有其他症状，如发热、呕吐、腹痛、精神萎靡等，应及时就医。以下是一些应对建议：
1.观察婴儿的症状：如果婴儿拉肚子的次数不多，精神状态良好，食欲正常，可以先观察一段时间。注意观察婴儿的大便次数、形状、颜色、气味等，以及是否有脱水的症状，如皮肤干燥、口唇干裂、尿量减少等。
2.调整饮食：如果是母乳喂养的婴儿，母亲应注意饮食，避免吃辛辣、油腻、生冷的食物。如果是人工喂养的婴儿，可以适当减少奶量，增加喂奶的次数，或者将奶冲稀一些。
3.补充水分：如果婴儿出现脱水的症状，应及时补充水分。可以给婴儿喂一些口服补液盐，或者温开水。如果婴儿不能口服补液，可以通过静脉输液的方式补充水分和电解质。
4.注意腹部保暖：婴儿的腹部容易受凉，导致拉肚子。可以给婴儿穿上肚兜，或者用热水袋热敷腹部。
5.服用药物：如果婴儿拉肚子的症状比较严重，可以在医生的指导下服用一些药物，如蒙脱石散、双歧杆菌四联活菌片等。这些药物可以收敛止泻，调节肠道菌群。
6.就医治疗：如果婴儿拉肚子的症状持续时间较长，或者伴有其他严重的症状，应及时就医。医生会根据婴儿的具体情况，进行相关的检查和治疗。
需要注意的是，三个月大的婴儿身体比较娇嫩，用药需要谨慎。在给婴儿服用药物之前，应先咨询医生的意见，按照医生的建议使用药物。同时，应注意保持婴儿的皮肤清洁，勤换尿布，避免尿布疹的发生。