功能性子宫出血通常是由内分泌失调、生殖系统器质性病变以及全身性疾病等原因造成。据医学研究，约有30% - 40%的功能性子宫出血与内分泌失调相关。
内分泌失调导致
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴功能紊乱：下丘脑分泌的促性腺激素释放激素，垂体分泌的促卵泡生成素、促黄体生成素，以及卵巢分泌的雌激素、孕激素等，它们之间的平衡关系被打破时，就会引发功能性子宫出血。比如青春期女孩，下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴发育尚不完善，容易出现内分泌失调，从而导致功能性子宫出血。而围绝经期女性，卵巢功能衰退，激素分泌不稳定，也常因内分泌失调引发该病。其他内分泌因素：甲状腺功能亢进或减退，也会影响性激素的正常调节，进而导致功能性子宫出血。甲状腺激素能影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，甲状腺功能异常时，会干扰激素的分泌和调节，使得子宫内膜不规则脱落或增生，引发子宫出血。
生殖系统器质性病变引发
子宫肌瘤：子宫肌瘤是女性常见的良性肿瘤，它会影响子宫的收缩，导致子宫内膜面积相对增大，引起子宫出血。黏膜下子宫肌瘤对子宫出血的影响更为明显，约有20% - 30%的子宫肌瘤患者会出现功能性子宫出血的症状。子宫内膜息肉：子宫内膜局部过度生长形成息肉，会干扰子宫内膜的正常脱落和修复，导致子宫异常出血。子宫内膜息肉患者中，约10% - 15%会出现功能性子宫出血的情况，而且息肉越大，出血的可能性越高。
全身性疾病所致
血液系统疾病：像血小板减少性紫癜、白血病等血液系统疾病，会影响人体的凝血功能，使得子宫出血不易止住，从而引发功能性子宫出血。例如血小板减少性紫癜患者，由于血小板数量减少或功能异常，凝血机制出现障碍，容易出现子宫出血不止的现象。肝脏疾病：肝脏是多种激素代谢的重要器官，肝脏疾病会影响雌激素的灭活，导致体内雌激素水平升高，刺激子宫内膜增生，引发功能性子宫出血。比如严重的肝硬化患者，肝脏对雌激素的代谢功能下降，就可能出现子宫异常出血的情况。