喉咙右侧吞咽疼痛，原因包括局部异物刺激、口腔溃疡、扁桃体炎等，以下分别进行说明：
一、局部异物刺激：如果喉咙右侧有鱼刺、小骨头或枣核等异物卡住，会对局部黏膜或更深组织形成刺激与损伤。在吞咽食物时会产生压迫感，引发显著疼痛，尤其在吞咽时疼痛会更为严重。这种情况通常需要前往医院，由医生借助纤维喉镜将异物取出。
二、口腔溃疡：当口腔溃疡位置靠近喉咙时，也可能导致喉咙疼痛。此时口腔黏膜会充血水肿，疼痛剧烈，尤其容易发生在口舌部位。可在医生指导下局部应用冰硼散、口腔溃疡散等药物，有助于缓解症状。同时要注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，多喝水。
三、扁桃体炎：多由细菌感染或病毒感染引起，常在受凉、劳累、机体抵抗力下降时诱发。会导致双侧咽部明显疼痛，吞咽时有异物感、咽痒、咽干、食欲减退、畏寒、高热以及头痛等症状。如果是病毒感染导致的，首先要多喝水、多休息，必要时可在医生指导下使用抗病毒口服液、利巴韦林颗粒等药物，并用呋喃西林溶液漱口以改善症状。若是细菌感染引起的扁桃体炎，可遵医嘱服用抗生素药物，如青霉素V钾片、头孢克肟片等。
此外，还有可能是急性咽炎、急性会厌炎等原因导致该情况。建议患者及时前往医院就诊，明确诊断后给予针对性治疗。