泌尿系结石的治疗方法需根据结石大小、部位等情况选择。一般来说，直径小于0.6厘米的肾结石，有一定概率自行排出。
药物治疗
利尿排石药物： 像枸橼酸氢钾钠等药物，能增加尿液pH值，降低尿中结石成分的饱和度，有助于小结石的排出。例如，对于一些尿酸结石患者，枸橼酸氢钾钠可以通过碱化尿液，减少尿酸结晶的形成。溶石药物： 针对特定成分的结石，如尿酸结石可使用别嘌醇等药物抑制尿酸生成，从而达到溶石效果。但药物治疗需要在医生指导下进行，因为不同成分的结石适用的溶石药物不同。
体外冲击波碎石
适用情况： 适用于直径在2 - 2厘米以下的肾结石或输尿管上段结石。一般来说，经过1 - 2次体外冲击波碎石治疗，大部分结石可被击碎。注意事项： 碎石前需要做好肠道准备，避免肠道气体影响碎石效果。碎石后要注意观察尿液中是否有结石碎片排出，同时要定期复查，看结石是否完全粉碎并排出。对于过于肥胖的患者，体外冲击波碎石效果可能不佳，因为冲击波在传递过程中会被脂肪吸收部分能量。
手术治疗
输尿管镜取石术： 对于输尿管中下段结石，直径较大难以自行排出的情况可采用。手术通过尿道插入输尿管镜，找到结石后用激光等将结石击碎取出。一般术后恢复较快，住院时间通常在3 - 5天左右。但术后要注意预防感染，按医嘱定期复查。经皮肾镜取石术： 适用于较大的肾结石，如直径大于2厘米的肾结石。手术是通过经皮肤穿刺建立通道到达肾脏，然后用器械取出结石。该手术创伤相对较大，术后恢复时间较长，一般需要1 - 2周，但对于较大结石能更彻底地清除。术后要密切关注出血等并发症情况。