在睡眠过程中，多数患者通常不会有意识醒来补水，所以经过一夜睡眠后，咽喉部黏膜往往比较干燥，还可能出现充血状况，呼吸时受到空气中微粒或寒冷干燥空气刺激，就可能引发咳嗽。此外，受神经兴奋性改变或部分呼吸道疾病等影响，患者也会在晨间出现咳嗽，具体如下：
一、神经兴奋性改变：
1.一般来说，夜间交感神经会抑制咳嗽反射，支气管黏膜的分泌物也相应减少，因而夜间咳嗽较少。
2.白天神经兴奋，咳嗽反射恢复，会有起床后咳嗽现象。但一些肺部疾病患者，因其呼吸困难、痰液较多，夜间也会出现阵咳或咳痰情况。
二、慢性咽炎：
慢性咽炎患者黏膜慢性充血，黏液腺分泌功能亢进导致黏液分泌增多，夜间咳嗽反射受抑制，所以早晨起床后咳嗽反射强烈就会引发咳嗽。
三、慢性支气管炎：
主要是由于吸烟、吸入粉尘或化学物质、空气污染以及细菌、病毒感染等因素，引起气管、支气管黏膜及周围组织的慢性非特异性炎症。通常以晨间咳嗽为主，清晨排痰较多，起床后的体位变化或其他时候的活动都可刺激排痰，睡眠时偶尔也会有阵咳或排痰。
四、慢性阻塞性肺疾病：
与慢性支气管炎、肺气肿密切相关，主要是因吸烟、吸入有害颗粒或气体导致持续性气流受限。以晨间咳嗽为主，夜间有阵咳或排痰。而且慢性阻塞性肺疾病患者常伴有慢性咳嗽，随病程发展可终身不愈。
此外，部分支气管扩张、肺脓肿患者也可能出现早上咳嗽，若未及时治疗，可能全天都会咳嗽。建议有此类症状的患者及时就医，遵医嘱服用止咳、化痰、消炎等药物，如美沙芬、氯化铵、头孢等，并积极治疗原发疾病。
总结：睡眠后咽喉部可能干燥充血，神经兴奋性改变和一些呼吸道疾病会导致晨间咳嗽，如慢性咽炎、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病等，有相关症状应及时治疗。