长时间玩手机会头疼的原因主要有以下几点：
1.眼睛疲劳：手机屏幕较小，字体较小，长时间盯着手机会导致眼睛疲劳，进而引起头疼。
2.颈部和肩部紧张：长时间低头看手机会导致颈部和肩部肌肉紧张，进而引起头疼。
3.大脑缺氧：长时间玩手机会导致大脑缺氧，进而引起头疼。
4.电磁辐射：手机会产生电磁辐射，长时间接触电磁辐射会对人体造成危害，进而引起头疼。
针对以上原因，可以采取以下措施来缓解头疼：
1.注意休息：每隔一段时间就要停下来，放松眼睛和颈部，做一些简单的伸展运动。
2.保持良好的姿势：看手机时要保持正确的姿势，不要低头或仰头，眼睛与手机屏幕保持平行。
3.增加户外活动：户外活动可以增加氧气摄入，缓解大脑缺氧的症状。
4.减少手机使用时间：尽量减少每天使用手机的时间，尤其是在晚上。
5.佩戴防辐射眼镜：可以佩戴防辐射眼镜，减少电磁辐射对眼睛的伤害。
如果头疼症状较为严重，可以考虑服用一些止痛药，如阿司匹林、布洛芬等。但是，这些药物只能缓解头疼症状，并不能根治病因。如果头疼症状持续时间较长或伴有其他症状，如恶心、呕吐、视力模糊等，应及时就医，进行详细的检查和治疗。