卵巢多囊综合症的发生是多种因素共同作用的结果。目前研究发现，约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗，这是其重要发病原因之一。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 多囊卵巢综合症具有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合症，那么女性成员患病的风险会相对增加。比如，母亲患有多囊卵巢综合症，其女儿患病的几率比正常人群要高很多。基因层面关联： 研究表明，一些特定的基因变异与多囊卵巢综合症的发生相关。例如，编码胰岛素受体底物 - 1等基因的变异，可能影响身体对胰岛素的反应，从而增加患多囊卵巢综合症的风险。
内分泌失调因素
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 正常情况下，下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴（HPO轴）处于精细的调节平衡状态。但在多囊卵巢综合症患者中，HPO轴调节出现紊乱。垂体分泌的促黄体生成素（LH）水平升高，促卵泡生成素（FSH）水平相对降低，LH/FSH比值大于2 - 3。这种失衡会影响卵巢的正常排卵功能，导致卵泡发育异常，不能正常排卵。雄激素水平异常： 患者体内雄激素水平升高，可表现为血清睾酮、雄烯二酮等升高。过多的雄激素会导致多毛、痤疮等症状，同时还会抑制卵泡发育，影响排卵。例如，很多多囊卵巢综合症患者会出现面部、胸前、腹部等部位毛发增多变粗的情况，就是雄激素过高的表现。
生活方式因素
饮食不均衡： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会使身体处于代谢紊乱的状态。比如，经常吃油炸食品、甜食等，容易导致体重增加，而肥胖又是多囊卵巢综合症的重要危险因素之一。有研究发现，体重超过正常范围10% - 15%的女性，患多囊卵巢综合症的几率明显升高。缺乏运动： 运动量过少也是诱发多囊卵巢综合症的因素之一。长期缺乏体育锻炼，身体的新陈代谢减慢，胰岛素抵抗会加重，进而影响HPO轴的正常调节。例如，每天久坐不动，很少进行跑步、游泳等运动的女性，相比经常运动的女性，更容易患上多囊卵巢综合症。