龟头炎的治疗药物需根据病因选择，一般细菌感染引起的龟头炎，常用莫匹罗星软膏等抗生素类药物。比如细菌感染导致的龟头炎，莫匹罗星软膏能针对革兰阳性球菌发挥抗菌作用。
细菌感染引发的龟头炎用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，可抑制细菌蛋白质合成，从而发挥抗菌活性，能有效缓解细菌感染引起的龟头炎症状。红霉素软膏： 也是常用的外用抗生素，对大多数革兰阳性菌、部分革兰阴性菌及一些非典型致病菌有抗菌作用，可用于细菌感染导致的龟头炎。
真菌感染引发的龟头炎用药
克霉唑乳膏： 是抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成及影响其代谢过程来发挥抗真菌作用，适用于念珠菌等真菌感染引起的龟头炎。酮康唑乳膏： 同样为广谱抗真菌药，能抑制真菌麦角甾醇的生物合成，进而达到抗真菌效果，可用于治疗真菌感染所致的龟头炎。
滴虫感染引发的龟头炎用药
甲硝唑凝胶： 对滴虫有杀灭作用，可用于滴虫感染引起的龟头炎。患者外用甲硝唑凝胶时，要注意保持局部清洁干燥。
特殊人群需注意
儿童患龟头炎时，用药需谨慎，应在医生指导下选择刺激性小的药物。孕妇及哺乳期女性若患龟头炎，用药前需告知医生自身情况，由医生评估后选择合适的治疗药物，避免自行盲目用药影响自身及胎儿健康。同时，在治疗龟头炎期间，要保持龟头局部清洁卫生，避免性生活，防止交叉感染。