上呼吸道感染时常用的药物需根据症状来选择。一般来说，缓解症状的药物中，解热镇痛药如对乙酰氨基酚可用于退热、缓解头痛等，它对大多数上呼吸道感染引起的发热、疼痛有一定作用，成人和儿童（需按体重计算剂量）都能使用，但严重肝肾功能不全者禁用。
对症治疗药物
退热止痛类：对乙酰氨基酚适用于体温超过38.5℃且有发热、头痛、肌肉酸痛等症状的患者，它通过抑制前列腺素合成发挥作用。布洛芬也可用于退热止痛，抗炎作用相对更强一些，不过6个月以下婴儿要谨慎使用，有消化道溃疡病史者需注意可能引发的胃肠道反应。减轻充血类：伪麻黄碱能缓解鼻腔黏膜充血，减轻鼻塞症状，但有高血压、甲状腺功能亢进等疾病的患者要慎用，因为可能会加重病情。
抗病毒药物
常用类型：对于流感病毒引起的上呼吸道感染，可使用奥司他韦等抗病毒药物，一般在发病48小时内使用效果较好，能缩短病程、减轻症状，但它也有一些禁忌，如严重肾功能不全者需调整剂量等。不过普通的病毒性上呼吸道感染大多为自限性，不一定都需要使用抗病毒药物。
抗菌药物
适用情况：上呼吸道感染多数由病毒引起，不需要使用抗菌药物。但如果明确有细菌感染，如出现脓痰、白细胞升高等情况，可选用抗生素，如青霉素类（不过要注意有无青霉素过敏史）、头孢菌素类等。但不能自行随意使用抗菌药物，必须由医生根据病情判断是否需要使用及选择合适的药物。上呼吸道感染时用药要谨慎，需根据具体症状和病情来合理选择药物。如果是儿童患病，用药更要格外小心，严格按照儿童的体重等情况来选择合适的药物剂型和剂量，最好在医生的指导下进行用药，避免不合理用药带来不良后果。同时，除了药物治疗，患者还应注意休息、多喝水等一般治疗措施来促进康复。