肠胃性感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，约占引发肠胃性感冒病毒的60%-70%。
病毒感染因素
柯萨奇病毒感染： 柯萨奇病毒通过消化道或呼吸道侵入人体，在肠道内大量繁殖，进而影响肠胃功能，引发恶心、呕吐、腹泻等症状。比如在人群密集的场所，如学校、幼儿园等，儿童更容易通过接触被病毒污染的物品而感染柯萨奇病毒，从而患上肠胃性感冒。埃可病毒感染： 埃可病毒也是导致肠胃性感冒的常见病毒之一，它同样可以经口进入人体，在肠道黏膜等部位引发炎症反应，使得肠胃的消化和吸收功能紊乱，出现腹痛、腹泻等表现。
饮食因素
不洁饮食： 食用了被病毒或细菌污染的食物，比如变质的水果、未彻底煮熟的海鲜等。例如，吃了被柯萨奇病毒污染的冷藏水果，就可能引发肠胃性感冒。一般来说，在夏季高温环境下，食物更容易滋生细菌和病毒，如果保存不当或食用前没有清洗干净，就增加了感染风险。过度饮食： 短时间内大量进食，加重肠胃负担。比如一次性吃过多油腻、辛辣的食物，会使肠胃消化功能失调，抵抗力下降，更容易受到病毒侵袭引发肠胃性感冒。像节假日期间，有些人暴饮暴食，就容易出现肠胃不适，进而可能发展为肠胃性感冒。
环境因素
气温突变： 突然的寒冷刺激会影响肠胃的血液循环，使肠胃的抵抗力降低。例如，在季节交替时，气温忽冷忽热，人体还没有适应，肠胃功能容易紊乱，此时就容易感染病毒引发肠胃性感冒。尤其是老人和儿童，对气温变化更为敏感。空气污染： 空气中的一些病毒、细菌等病原体含量较高时，也会增加感染肠胃性感冒的几率。比如在雾霾天气，空气中悬浮着各种颗粒物和病原体，人们吸入后可能会影响呼吸道和肠胃的健康，导致肠胃性感冒的发生。