非月经期出现褐色分泌物以及腰疼可能与多种因素有关，以下是一些可能的原因和建议：
1.排卵期出血：如果褐色分泌物出现在两次月经中间，可能是排卵期出血。这是由于排卵后雌激素水平下降，引起子宫内膜脱落，导致少量出血。排卵期出血通常持续2-3天，伴有轻微的腰疼或下腹坠胀感，一般不需要特殊治疗。
2.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等，可能导致非月经期出血和腰疼。此外，还可能伴有白带异常、异味等症状。建议及时就医，进行妇科检查和白带常规等检查，明确诊断后进行相应的治疗。
3.内分泌失调：长期的压力、情绪波动、生活不规律等因素可能导致内分泌失调，引起月经紊乱和腰疼。此外，还可能伴有皮肤粗糙、长痘、脾气暴躁等症状。建议保持良好的生活习惯，避免熬夜，调整心态，如有必要，可以就医进行激素六项检查，根据结果进行调理。
4.子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种良性肿瘤，可能导致月经量增多、经期延长、非月经期出血等症状，还可能伴有下腹坠胀、腰疼等不适。如果肌瘤较小，没有明显症状，可以定期复查；如果肌瘤较大或症状明显，可能需要手术治疗。
5.其他：子宫内膜息肉、宫颈癌、卵巢功能早衰等也可能导致类似症状。
如果出现非月经期褐色分泌物和腰疼，建议及时就医，进行详细的检查，如B超、妇科检查、激素六项等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。此外，在就医前应注意个人卫生，避免性生活，以免加重病情。