非经期有褐色分泌物腰疼可能与多种因素有关，以下是一些常见的原因及解决办法：
1.排卵期出血：如果褐色分泌物出现在两次月经中间，可能是排卵期出血。这是由于排卵后雌激素水平下降，引起子宫内膜脱落，导致少量出血。一般不需要特殊治疗，注意休息和保暖即可。
2.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等，可能导致非经期出血和腰疼。同时可能伴有白带异常、异味、瘙痒等症状。需要进行妇科检查和白带常规等检查，明确诊断后，使用抗生素、栓剂等药物治疗。
3.内分泌失调：长期的压力、情绪波动、生活不规律等可能导致内分泌失调，引起月经紊乱和腰疼。可以通过调整生活方式、保持心情愉悦、规律作息等方式改善。如果症状严重，需要就医，在医生的指导下使用药物调节内分泌。
4.子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种良性肿瘤，可能导致月经量增多、经期延长、非经期出血等症状。较大的肌瘤还可能引起腰疼。需要进行B超等检查，明确诊断后，根据肌瘤的大小、位置等情况选择合适的治疗方法，如药物治疗、手术治疗等。
5.其他：子宫内膜息肉、宫颈癌、节育环不适等也可能导致类似症状。
如果出现非经期有褐色分泌物腰疼的情况，建议及时就医，进行详细的检查，明确原因后，采取相应的治疗措施。同时，注意个人卫生，保持外阴清洁，避免过度劳累和剧烈运动。