扁桃体只发炎一边往往是不正常的。通常情况下，扁桃体炎发作时多呈双侧对称性。而若是扁桃体仅有一边发炎，可能是扁桃体周围出现炎症感染并向内侵犯或推移至扁桃体引起，此时需尽早完善颈部CT检查，以排除咽旁间隙感染等疾病。具体如下：
一、如果经检查确定为咽旁间隙感染等疾病，就需要使用足量的抗生素（如罗红霉素片、阿奇霉素片）来控制感染，必要时还需切开排脓，这样症状才能有效得到缓解。但要注意，对本类药物过敏者禁用，其不良反应包括胃部不适、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等；
二、倘若为反复发作的扁桃体一边发炎，那么则要排除先天性疾病，比如第二鳃裂瘘管等，因为这类疾病的内部开口在扁桃体的上方，当瘘管内有脓栓时，会导致扁桃体一边发炎反复发作。
总之，如果出现扁桃体只发炎一边的情况，应及时前往正规医院，由专业医生根据个人具体情况进行科学治疗，且上述药物均需遵医嘱使用。