肾气阴两虚证的主要病因如下：
1.先天禀赋不足：如果母亲在怀孕期间身体素质较差，或肾气不足，可能会导致胎儿在母体内发育不良，从而增加出生后患上肾气阴两虚证的几率。
2.后天失养：儿童时期如果生长发育迟缓，或没有摄入足够的营养物质，可能会导致肾气阴两虚证的发生。
3.房事过度：如果性生活过于频繁，或长期手淫，可能会导致肾精亏虚，从而引起肾气阴两虚证。
4.工作压力大：长期从事高强度的脑力或体力劳动，可能会导致身体过度疲劳，从而引起肾气阴两虚证。
5.久病伤肾：如果患有某些慢性疾病，如慢性肾炎、糖尿病、高血压等，可能会导致肾气阴两虚证的发生。
6.年老体衰：随着年龄的增长，人体的肾气会逐渐衰退，从而引起肾气阴两虚证。