干燥综合征的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与遗传、感染、免疫等多种因素有关。据研究，遗传因素在其中起到一定作用，某些基因的遗传多态性会增加患干燥综合征的风险。
遗传因素：
基因关联： 研究发现，人类白细胞抗原（HLA）系统中的某些基因，如HLA - DR3、HLA - DR4等与干燥综合征的发病相关。携带这些基因的人群，患干燥综合征的概率相对较高。比如有家族遗传倾向的人群，其亲属患干燥综合征的几率比普通人群要高一些。
感染因素：
病毒感染： 病毒可能是诱发干燥综合征的重要因素之一。例如EB病毒、丙型肝炎病毒等。EB病毒感染可能会激活B淋巴细胞，导致免疫功能紊乱，进而引发干燥综合征相关的免疫反应。有研究表明，在干燥综合征患者的唾液腺等组织中，可能检测到EB病毒的相关成分。丙型肝炎病毒感染也与干燥综合征的发病有一定关联，部分丙型肝炎病毒感染的患者会出现干燥综合征的症状。
免疫因素：
自身免疫反应异常： 人体的免疫系统出现异常是干燥综合征发病的关键。体内的自身抗体，如抗SSA抗体、抗SSB抗体等会攻击自身的唾液腺、泪腺等外分泌腺体，导致腺体分泌功能受损，出现口干、眼干等干燥综合征的典型症状。免疫系统的这种异常攻击会持续破坏外分泌腺体，使病情逐渐发展，影响患者的生活质量。例如，抗SSA抗体阳性的人群患干燥综合征的风险相对较高，而且这类患者病情可能相对更容易活动。