脊髓空洞症的治疗需根据具体情况选择合适方式，一般来说手术治疗是重要手段，如对于由颅颈交界区畸形等原因引起的脊髓空洞症，约60% - 70%的患者通过手术可改善症状。
手术治疗方式
后颅窝减压术：适用于因小脑扁桃体下疝导致脊髓空洞的患者。通过切除部分颅骨和硬脑膜，扩大后颅窝空间，减轻对小脑扁桃体等结构的压迫，从而缓解脊髓空洞进展。一般手术时间在2 - 4小时左右。脊髓空洞分流术：包括空洞 - 蛛网膜下腔分流、空洞 - 腹腔分流等。比如空洞 - 腹腔分流术，是将脊髓空洞内的液体引流到腹腔，被腹腔吸收，从而降低脊髓空洞内压力，改善脊髓功能。但术后需注意防止分流管堵塞等并发症。
药物辅助治疗
神经营养药物：常用维生素B族，如维生素B1、维生素B12等。维生素B1参与神经组织中糖代谢等过程，维生素B12对神经髓鞘合成有重要作用，可促进神经修复，一般需长期服用，每日维生素B1剂量通常为10 - 30mg，维生素B12可肌肉注射，每次0.5 - 1mg，每周2 - 3次。改善微循环药物：像地巴唑，能舒张血管，改善脊髓的血液供应，从而利于脊髓功能恢复，一般成人每次5 - 10mg，每日3次。
康复治疗助力
运动康复：根据患者病情制定个体化运动方案。比如病情较轻者可进行简单的肢体屈伸运动，每天进行3 - 4次，每次15 - 20分钟，逐渐增加运动强度和时间。对于上肢有一定功能的患者，可练习拿取轻物体等精细动作训练，每周进行5 - 6天。物理因子治疗：包括针灸、理疗等。针灸可选取相关穴位，如上肢病变可选取合谷、曲池等穴位，通过刺激穴位调节神经功能。理疗中的经皮电刺激神经疗法（TENS），可促进神经肌肉兴奋，改善肌肉营养状态，每次治疗时间约20 - 30分钟，每周进行3 - 5次。