慢性结肠炎常用药物包括氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。氨基水杨酸制剂中，柳氮磺吡啶是常用药物之一，一般需连续服用数周甚至数月。
氨基水杨酸制剂类药物
美沙拉嗪： 分为口服制剂和灌肠剂等。口服美沙拉嗪可作用于肠道炎症部位，抑制炎症介质的产生。例如，成人常用剂量一般根据病情调整，通常每日剂量在2 - 4克左右。灌肠剂美沙拉嗪适用于病变局限在直肠的患者，通过直肠给药直接作用于病变部位。奥沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂的一种，它在结肠内被细菌分解为两分子5 - 氨基水杨酸发挥作用，一般成人初始剂量可为每日1 - 2克，分2 - 3次服用。
糖皮质激素类药物
泼尼松： 属于全身性应用的糖皮质激素，对于病情较重的慢性结肠炎患者可能会使用。通常初始剂量根据病情严重程度而定，一般成人起始剂量可能在每日10 - 60毫克不等，之后会根据病情逐渐调整剂量。但长期使用糖皮质激素可能会有较多副作用，如骨质疏松、感染风险增加等。氢化可的松： 也可用于慢性结肠炎的治疗，一般可通过静脉滴注等方式给药，对于急性发作且病情较重的患者可能会选用，静脉滴注剂量需根据患者具体情况由医生调整，一般初始剂量可能在每日100 - 300毫克左右。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤： 适用于对氨基水杨酸制剂疗效不佳或有激素依赖的慢性结肠炎患者。成人常用剂量一般开始时每日1 - 2.5毫克/千克体重，需要定期监测血常规等指标，因为可能会引起骨髓抑制等不良反应，一般用药过程中每1 - 2周需复查血常规等。巯嘌呤： 作用机制与硫唑嘌呤类似，也可用于慢性结肠炎的治疗，剂量一般根据患者体重等情况调整，初始剂量可能在每日1 - 2毫克/千克体重左右，同样需要密切监测血常规等指标，观察是否出现不良反应。