药物流产判断是否干净主要有以下方面。
一、阴道出血情况：
1.药流术后一周或十天左右会有少量出血，这是正常现象，且流血会逐渐减少，颜色由鲜红色渐变为褐色或黑色。
2.若阴道出血反复且淋漓不尽，则可能存在不全流产情况。
二、B超检查：
1.一般建议药流后两周左右进行B超检查。
2.B超提示宫腔内无残留，表明药流干净；若提示宫腔内有混合回声，则提示药流不全，可直接观察内膜是否有残留来判断是否流干净。
三、特殊情况：若B超提示无残留组织但阴道仍有出血，通常是药流已干净但宫缩不良。
总之，判断药流是否干净主要结合B超查看宫腔内有无残留组织，若B超提示无混合回声则表明药流干净，还需结合阴道是否还有流血来考虑是否需给予药物治疗。若药流不全且残留物较大，则需进行清宫治疗。
尾段总结：通过对阴道出血状况、B超检查结果以及特殊情况的综合考量，能够较为准确地判断药物流产是否干净，以便采取合适的后续治疗措施。