睑板腺囊肿主要是由于睑板腺出口阻塞，导致腺体的分泌物潴留在睑板内，对周围组织产生慢性刺激而引起的。一般来说，睑板腺分泌功能旺盛的人群相对更容易出现睑板腺囊肿。
睑板腺分泌异常相关
睑板腺油脂分泌过多：当睑板腺分泌油脂过多时，就容易堵塞睑板腺出口。比如，一些青春期的青少年，由于体内激素水平变化，睑板腺分泌活跃，油脂分泌量比平常人多，就增加了睑板腺出口被堵塞的风险，进而引发睑板腺囊肿。睑板腺油脂分泌过少：虽然相对少见，但睑板腺油脂分泌过少，使得睑板腺的润滑等功能受到影响，也可能间接导致分泌物排出不畅。例如，一些患有眼部慢性疾病的人，可能会影响睑板腺的正常分泌功能。
眼部慢性炎症影响
结膜炎引发：结膜炎长期不愈，炎症可能波及睑板腺，导致睑板腺开口处受到炎症刺激，出现水肿、狭窄等情况，阻碍分泌物排出。像细菌性结膜炎如果没有得到及时有效的治疗，炎症持续存在，就可能增加睑板腺囊肿的发生几率。睑缘炎导致：睑缘炎会使睑缘部位的皮肤和腺体受到影响，造成睑板腺开口附近的组织病变，影响分泌物的正常排出。例如，鳞屑性睑缘炎患者，睑缘部位会有鳞屑等异常情况，容易干扰睑板腺分泌物的排出通道。
生活习惯因素
用眼不卫生：长时间不注意眼部卫生，用脏手揉眼睛等行为，容易将外界的细菌、灰尘等带到眼部，导致睑板腺开口被污染堵塞。比如，每天长时间使用电子设备后，手部接触各种物体，再揉眼睛时就可能把脏东西带到睑板腺开口处。长时间佩戴不合适的眼镜：不合适的眼镜，如镜框过紧等，会对眼睑造成压迫，影响睑板腺的正常分泌和排泄功能。例如，一些人佩戴的眼镜镜框过小过紧，长时间压迫眼睑，就可能干扰睑板腺的正常工作，增加睑板腺囊肿的发生可能性。