新生儿便秘可能由多种原因引起。一般来说，新生儿便秘约有10% - 20%是由生理因素导致的。
喂养相关原因
母乳喂养不当： 如果母乳中营养成分不均衡，比如脂肪含量过少，可能会导致新生儿便秘。母乳中脂肪含量约为3% - 5%，当低于这个合理范围时，就可能影响新生儿肠道蠕动，引发便秘。人工喂养问题： 配方奶冲调不当也会造成便秘，比如冲调的奶粉浓度过高，新生儿摄入后难以消化，就容易出现便秘情况。正常配方奶应按照产品说明的比例进行冲调。
肠道功能发育不完善
肠道神经调节不成熟： 新生儿的肠道神经调节系统还处于发育阶段，协调性较差，容易出现肠道蠕动不规律的情况。一般新生儿出生后的前几个月，肠道神经调节功能逐渐完善，但在初期可能会因调节不成熟而引发便秘。肠道肌肉力量不足： 新生儿肠道的肌肉力量相对较弱，推动粪便排出的能力有限。随着新生儿逐渐长大，肠道肌肉力量会慢慢增强，便秘情况也会相应改善。
疾病因素影响
先天性肠道畸形： 像先天性巨结肠就是导致新生儿便秘的常见先天性肠道畸形之一。患有先天性巨结肠的新生儿，肠道某段神经节细胞缺失，导致肠道蠕动功能异常，出现顽固性便秘，这种情况需要及时就医进行诊断和治疗。甲状腺功能减退： 新生儿甲状腺功能减退时，身体代谢会减慢，肠道蠕动也会随之减缓，从而引发便秘。如果新生儿同时伴有反应迟钝、吃奶少等症状，要警惕甲状腺功能减退的可能，需及时检查甲状腺功能。