新生儿便秘可能由多种原因引起。一般来说，新生儿肠道功能尚未完全发育成熟是常见因素之一。比如，新生儿的肠道神经调节功能不完善，肠道蠕动相对较慢，就容易导致便秘。
喂养因素导致
母乳不足： 如果母乳喂养的新生儿，母乳分泌量不足，宝宝摄入的奶量不够，就可能出现便秘。因为奶量不足会使肠道内形成的粪便量少，肠道蠕动刺激不够，从而引发便秘。配方奶冲调不当： 配方奶冲调过稠，会导致新生儿摄入的矿物质等成分相对过多，超过肠道的消化吸收能力，也容易引起便秘。比如，按照标准比例冲调配方奶是比较合适的，若冲调过浓就可能出问题。
肠道自身问题
肠道畸形： 少数新生儿可能存在肠道畸形的情况，如先天性巨结肠等。先天性巨结肠是由于直肠或结肠远端的肠管持续痉挛，粪便淤滞在近端结肠，使该肠段肥厚、扩张，从而导致顽固性便秘。一般这种情况需要医生进一步检查诊断。肠道神经节发育异常： 肠道神经节发育异常也可能影响肠道的正常蠕动，导致粪便通过困难，引发便秘。这需要专业的医学检查来明确。
其他因素
环境温度变化： 新生儿对环境温度比较敏感，如果环境温度过高或过低，可能会影响新生儿的胃肠功能，导致肠道蠕动紊乱，进而引起便秘。比如，环境温度过高时，新生儿出汗多，水分丢失多，若没有及时补充，就容易便秘。疾病影响： 某些疾病也可能导致新生儿便秘，如甲状腺功能减退症。甲状腺功能减退的新生儿，全身代谢降低，胃肠蠕动减慢，就容易出现便秘症状。这需要医生通过相关检查来排查是否存在疾病因素。