穿刺活检肺部一般风险较低，但也存在一定可能性的危险。通常来说，肺部穿刺活检的总体并发症发生率在5%左右。
穿刺活检的操作过程风险
穿刺部位出血风险： 在进行肺部穿刺活检时，有可能出现穿刺部位的少量出血，一般通过压迫等简单处理即可缓解，但极少数情况下可能会出现较明显的出血，需要进一步处理。气胸发生风险： 穿刺过程中损伤到肺部组织，导致气体进入胸腔引发气胸，发生率大概在3% - 10%左右。如果气胸量少，可能没有明显症状，可自行吸收；但气胸量较多时，会出现胸闷、气短等症状，需要进行胸腔闭式引流等处理。
患者自身状况带来的风险差异
老年人风险相对高： 老年人常伴有基础疾病，比如慢性阻塞性肺疾病、心肺功能不全等，进行肺部穿刺活检时，出现并发症的风险可能比年轻人更高。因为老年人的心肺储备功能较差，对气胸、出血等情况的耐受能力较弱。凝血功能异常者风险大： 如果患者本身存在凝血功能障碍，像患有血友病或者长期服用抗凝药物等情况，穿刺后出血的风险会显著增加，可能导致局部血肿形成，甚至影响肺部周围重要结构的功能。
术后恢复相关风险
感染风险： 虽然发生概率较低，大概在1%以下，但肺部穿刺活检属于有创操作，存在引发肺部感染的可能。患者术后可能会出现发热、咳嗽加重等症状，需要使用抗生素进行抗感染治疗。穿刺部位疼痛： 大部分患者术后会有穿刺部位的疼痛，一般在可耐受范围内，经过对症处理后会逐渐缓解，但也有少数患者疼痛较为剧烈，需要进一步评估原因并处理。