治灰指甲的药主要有外用和口服两类。一般来说，外用药物相对较为安全，但起效可能慢一些；口服药物效果相对更快，但需要注意可能存在的副作用。
外用抗真菌药
阿莫罗芬搽剂：它是一种局部外用的抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥作用。每周使用1-2次即可，一般连续使用几个月能起到较好效果。不过，使用时要注意避免接触到周围正常皮肤，以免引起刺激。环吡酮胺乳膏：能抑制真菌细胞膜的合成，从而达到抗真菌的目的。每天涂抹2次左右，涂抹在患处及周围皮肤，坚持使用一段时间对灰指甲有一定治疗作用。但如果使用后局部出现红肿、瘙痒等过敏症状，应立即停药。
口服抗真菌药
伊曲康唑胶囊：属于全身用抗真菌药，它可以干扰真菌细胞色素P450的活性，影响真菌细胞膜合成。通常采用冲击疗法，即服用一周，停药三周为一个疗程，一般需要2-3个疗程。不过，使用前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响，有肝脏疾病的患者要谨慎使用。特比萘芬片：通过抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜的合成。一般每天服用一次，连续服用数月。同样，服用前也需要关注肝功能情况，孕妇和哺乳期妇女要避免使用。
复方制剂类药物
有些药物是由多种抗真菌成分组成的复方制剂。比如复方酮康唑软膏，它含有酮康唑和丙酸氯倍他索等成分，酮康唑抗真菌，丙酸氯倍他索有抗炎、抗过敏作用。但要注意，不能长期大面积使用，否则可能引起皮肤萎缩、毛细血管扩张等不良反应，而且真菌性皮肤病患者有皮肤破损时也不适合使用。另外还有复方乳酸乳膏等与抗真菌相关的复方制剂辅助治疗，但使用时都要遵循正确方法和注意事项。