胆囊结石的形成是多种因素共同作用的结果。胆汁中胆固醇、胆色素等成分比例失调，是引发胆囊结石的重要原因之一。比如，当胆汁中胆固醇含量过高，超过了胆汁酸和磷脂所能溶解的限度时，胆固醇就容易析出结晶，逐渐形成结石。
胆汁成分比例失调：
胆固醇过饱和： 正常情况下，胆汁中的胆固醇、胆汁酸与磷脂保持一定比例，能使胆固醇呈溶解状态。但如果身体代谢出现问题，比如肝脏分泌过多胆固醇，或者肠道对胆汁酸的重吸收增加等，就会导致胆汁中胆固醇相对过多，超过胆汁酸的溶解能力，胆固醇就会结晶沉淀，慢慢形成结石。据统计，约70%的胆囊结石患者与胆固醇过饱和有关。胆色素代谢异常： 胆道感染时，细菌产生的β - 葡萄糖醛酸酶会将胆汁中的结合胆红素水解为游离胆红素，游离胆红素与钙结合形成胆红素钙，进而沉淀形成胆红素结石。
胆囊收缩功能异常：
胆囊排空延迟： 长期禁食、全胃肠外营养等情况会使胆囊收缩功能降低，胆汁淤积在胆囊内。胆汁中的成分就容易沉淀形成结石。比如一些术后长时间不能进食的患者，胆囊结石的发生率会相对增高。胆囊蠕动功能障碍： 某些疾病影响胆囊的正常蠕动，如糖尿病患者可能存在自主神经病变，影响胆囊的正常运动，导致胆汁排出不畅，胆汁中的成分聚集形成结石。
其他因素影响：
遗传因素： 有研究发现，胆囊结石具有一定的遗传倾向。如果家族中有胆囊结石患者，其亲属患胆囊结石的风险比普通人要高一些。例如，父母患有胆囊结石，子女患胆囊结石的概率比无家族史者高出2 - 3倍。女性激素影响： 女性体内的雌激素会影响胆汁的成分，还会影响胆囊的收缩功能。女性在妊娠期间，体内雌激素水平升高，会使胆汁中胆固醇含量增加，同时胆囊收缩功能减弱，容易形成胆囊结石。而且女性在绝经后，雌激素水平下降，胆囊结石的发生率相对会有所降低，但仍高于男性。肥胖因素： 肥胖人群体内胆固醇合成增加，胆汁中胆固醇含量升高，同时肥胖者胆囊收缩功能往往也较差，这些因素都增加了胆囊结石的发生风险。一般体重指数（BMI）大于30的肥胖人群，胆囊结石的患病率明显高于正常体重人群。